Główna siedziba PKS Grodzisk Maz. mieści się w Grodzisku Mazowieckim przy ul. Chełmońskiego 33. Większość autobusów obsługujących linie ZTM garażuje w Warszawie, w bazie na Targówku przy ul. Klementowickiej. Plac postojowy jest w stanie pomieścić ponad 100 autobusów. Obiekt jest bardzo ubogo wyposażony, posiada jedynie prowizoryczne stanowiska do tankowania, nie posiada automatycznej myjni. Na terenie bazy znajduje się hotel pracowniczy, dla kierowców którzy w większości pochodzą spoza Warszawy.
W zajezdni garażują 54 autobusy Scania OmniCity z kontraktu 2007-2016 i 42 z kontraktu 2008-2017.